در پی دستور مسوولان دولت یازدهم درخصوص دولتیشدن صندوق قرضالحسنه شهیدان رجایی و باهنر تخلفات این صندوق در دولت دهم آشکار شد. چندی پیش مشخص شد این صندوق در دولت دهم به تعدادی از اعضای کابینه تسهیلات چند دهمیلیونتومانی پرداخت کرده که با ادعای وامگیرندگان مبنی بر عدم توان بازپرداخت اقساط آن سبب شد مدیرعامل وقت این صندوق از حمید بقایی، معاون وقت رییسجمهور در امور اجرایی و سرپرست نهاد ریاستجمهوری طلب استمداد کند.
در نتیجه این درخواست در خرداد سال 1392 طی دستور کتبی از سوی بقایی خواسته میشود که از حساب نهاد نسبت به تامین مبلغ مورد نظر بابت کمک به صندوق، مبلغ 300میلیونتومان طی یک فقره چک در تاریخ دوم تیر 1392 از سوی بانک ملی شعبه نهاد به حساب صندوق واریز شود. در حالی که طبق نامه ارسالی، کمک فوق یعنی مبلغ 300میلیونتومان صرفا برای کمک به افرادی که به دلیل عدم بضاعت مالی توان بازپرداخت وام خود را نداشتند؛ درخواست شده بود اما به تصمیم مسوولان وقت صندوق این مبلغ صرف تسویه بازپرداخت اقساط وامهای گرفتهشده از سوی وزرا و مقامات ارشد کابینه و مدیران ارشد دولت شد. قابلتوجه اینکه بازپرداختهای ماهانه نیز مبلغی در حدود 500هزار تا یکمیلیونتومان بوده که پس از پرداخت چند ماه، بعضی از وامگیرندگان با درخواستی مبنی بر عدم توانایی در بازپرداخت تسهیلات مبلغ اقساط خود را به 250هزارتومان در هر ماه کاهش دادهاند که البته از مرداد سال 1392 و همزمان با تغییر دولت و خروج وزرا از کابینه، بازپرداخت باقیمانده تسهیلات از سوی افراد ذیربط نیز به حال معوق مانده که متاسفانه بهدلیل نبود ضمانتهای لازم که حتی در بعضی موارد هیچ ضمانتی هم وجود ندارد روند بازپسگیری اقساط با مشکل مواجه شده است.